Beberapa lembaga internasional yang menjadi mitra kerja sama dengan Prodi Magister Ilmu Kedokteran Tropis FK-KMK UGM antara lain sebagai berikut.
Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University
Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University merupakan salah satu universitas terbaik di Thailand dan menjadi mitra kerja sama Magister Ilmu Kedokteran Tropis FK-KMK UGM
Swiss Tropical and Public Health Institute
Swiss Tropical and Public Health Institute (Swiss TPH) merupakan perguruan tinggi asal Swedia yang secara spesifik memiliki tujuan pendidikan dibidang penyakit infeksi tropis.
WHO (World Health Organization)
WHO (World Health Organization) merupakan lembaga internasional yang secara spesifik menangani permasalahan kesehatan secara global. Beberapa peneliti dan pengelola WHO telah menjadi mitra dengan Kedokteran Tropis UGM sejak lama
Wiki Tropica
Wiki Tropica merupakan kerja sama global yang memberikan akses kepada para mahasiswa untuk menggali informasi tentang dunia kesehatan dan kedokteran secara global